1、颜色区别。首先最明显的区别就是果实外观上的区别了，我们生活中常见的番茄大家都知道，全体都是红色。而黑番茄顾名思义，其果皮及果肉的颜色都非常深，呈现出黑红的颜色。导致很多人都认为黑番茄是由于转基因所导致，其实黑番茄的颜色是由于其品种的遗传特性决定的。
2、抗寒能力。只要是种植过普通红番茄的朋友都知道，红番茄的抗寒能力是非常弱的，温度较低的时候会导致红番茄出现冻害现象，严重影响红番茄的生长。不过黑番茄却有着较强的抗寒能力，能够在低温环境中正常生长。并且黑番茄的原产地年平均温度较低，所以黑番茄更加适宜种植在低寒地区。
3、果皮厚度。红番茄的果皮是比较厚的，在生吃的时候能够明显感觉到果皮的存在，并且果皮对生吃的口感会造成一定影响。而黑番茄的果皮非常